最近，瑞典卡羅林斯卡學(xué)院和愛沙尼亞醫(yī)療技術(shù)能力中心的科學(xué)家合作，開發(fā)出了一種新的基因表達(dá)分析方法，讓通過(guò)全血RNA-seq進(jìn)行生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和分析，將會(huì)變得更為簡(jiǎn)單。
血液攜帶的細(xì)胞，可提供多種有用的生物標(biāo)志物。血液作為一種液體活檢，在臨床研究中有著廣泛的應(yīng)用，因?yàn)槠淙拥暮?jiǎn)便性和快速動(dòng)態(tài)性：大多數(shù)的細(xì)胞是攜帶氧的紅細(xì)胞，在所有血液RNA當(dāng)中致使球蛋白R(shí)NA分子50%?80%的富集。
技術(shù)上的偏差
球蛋白如此高的普遍性，因此，血液相關(guān)基因表達(dá)生物標(biāo)志物的研究，就變得復(fù)雜化，從而造成了技術(shù)偏差，并留下了無(wú)法探測(cè)到的生物相關(guān)分子。根據(jù)研究人員介紹，這項(xiàng)研究首次介紹了一種詳細(xì)方法??GlobinLockTM??能夠克服紅細(xì)胞引起的血樣分析的局限性，紅細(xì)胞使得從血液中識(shí)別或跟蹤下游的任何生物標(biāo)志物，都變得復(fù)雜化。已公布的和正在申請(qǐng)專利的試驗(yàn)，最大限度地減少了對(duì)試劑和樣品材料的需求，從而使得它成為一種有效和強(qiáng)大的工具。
本文第一作者、KaarelKrjut?kov博士說(shuō)：“GlobinLock的球蛋白下降率，對(duì)于任何應(yīng)用程序來(lái)說(shuō)是足夠的。它將球蛋白的普遍率從以前的63%減少到了5%，這使得它成為生物科技公司的一種有效工具，被添加到試劑盒中�！�
DNA鏈
這種新的方法包括一對(duì)短的合成DNA鏈，通過(guò)高度特異性結(jié)合，可沉默大多數(shù)的球蛋白R(shí)NA分子。根據(jù)研究人員解釋，這兩條鏈被引入到純化的RNA樣品中，并且，在RNA變性后是立即有效的，整個(gè)互補(bǔ)的DNA合成過(guò)程，只有十分鐘的潛伏期。
鎖定的DNA分子特異性地結(jié)合在球蛋白的RNApoly-A位點(diǎn)，這還需要進(jìn)一步分析。因此，在下游操作之前，球蛋白R(shí)NA是被“鎖定的”，在血液RNA生物標(biāo)志物的應(yīng)用中并不會(huì)引起技術(shù)的偏差。
JuhaKere教授說(shuō)：“我們發(fā)現(xiàn)，球蛋白鎖定是完全有效的，不僅適用于人類的樣本，也廣泛適用于動(dòng)物模型，如小鼠、大鼠、牛、狗甚至斑馬魚�！�
應(yīng)用測(cè)序技術(shù)尋找生物標(biāo)志物，已經(jīng)有了一系列的研究進(jìn)展，例如，2019年10月，蘇州大學(xué)第一附屬醫(yī)院譚友文副教授帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)對(duì)血清microRNA（miRNA）的表達(dá)譜進(jìn)行研究，確定其是否可作為HCC的一種新的診斷標(biāo)志物，研究成果發(fā)表在PLoSONE上。
2019年，日本理化學(xué)研究所（RIKEN）生命科學(xué)技術(shù)中心（CLST）和澳大利亞HarryPerkins醫(yī)學(xué)研究所的研究人員通過(guò)RNA測(cè)序，發(fā)現(xiàn)了很多個(gè)基因，它們?cè)谠S多不同類型的癌癥中是上調(diào)的，從而為開發(fā)生物標(biāo)志物檢測(cè)、早期發(fā)現(xiàn)癌癥進(jìn)而及時(shí)治療，提供了機(jī)會(huì)。
今年2月，浙江大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)研究所李繼承教授領(lǐng)銜的課題組采用iTRAQ標(biāo)記結(jié)合2DLC-MS/MS，以及Solexa測(cè)序?qū)DR-TB患者，藥物敏感結(jié)核�。―S-TB）患者，和健康對(duì)照組血清中的蛋白質(zhì)組和miRNA組進(jìn)行了比較分析，鑒定出MDR-TB診斷的潛在生物標(biāo)志物。
本文來(lái)自：逍遙右腦記憶 http://portlandfoamroofing.com/gaozhong/1114065.html
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