生物樣本庫也被稱作“生物銀行”，既然是銀行，就不單單僅具備“倉庫”的存儲(chǔ)功能。生物樣本庫的核心是生物樣本和臨床信息，需要全面的信息化運(yùn)作和管理。但由于生物樣本庫是一個(gè)多學(xué)科領(lǐng)域，信息化還需要經(jīng)歷一個(gè)從專職到專業(yè)的轉(zhuǎn)變歷程。
生物樣本庫不單單僅具備“倉庫”的存儲(chǔ)功能。
在信息時(shí)代下，生物樣本庫與大數(shù)據(jù)的碰撞會(huì)發(fā)生怎樣的化學(xué)反應(yīng)？
“如果樣本沒有信息的轉(zhuǎn)化，其作為轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)和個(gè)體化醫(yī)學(xué)研究的寶貴資源也將成為一句空話�！比涨埃谟缮锕戎鬓k的2016（第三屆）生物樣本庫與臨床研究論壇上，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院教授王偉業(yè)語氣堅(jiān)定：“建設(shè)生物樣本庫的最終目的是將其最大化地轉(zhuǎn)化為信息，信息化一定是生物樣本庫建設(shè)的下一個(gè)重點(diǎn)。”
生物樣本庫也被稱作“生物銀行”，既然是銀行，就不單單僅具備“倉庫”的存儲(chǔ)功能。王偉業(yè)表示，生物樣本庫的核心是生物樣本和臨床信息，需要全面的信息化運(yùn)作和管理。但由于生物樣本庫是一個(gè)多學(xué)科領(lǐng)域，信息化還需要經(jīng)歷一個(gè)從專職到專業(yè)的轉(zhuǎn)變歷程。
數(shù)據(jù)共享如同“戒煙”
生物樣本庫的建設(shè)如同計(jì)算機(jī)操作，在鍵盤上打字是“進(jìn)口”，計(jì)算機(jī)進(jìn)行運(yùn)算處理是“操作”，屏幕中顯示出結(jié)果是“出口”。在我國(guó)，由于生物樣本資源豐富，操作相對(duì)容易，所以“進(jìn)口”的速度很快，但是，資源應(yīng)用的“出口”卻問題突出。
“生物樣本庫與傳統(tǒng)生物資源保存最根本的區(qū)別就是樣本的信息化問題�！蓖鮽I(yè)表示，生物樣本庫一定要與傳統(tǒng)的、以單一課題需求為目的的生物樣本儲(chǔ)存有本質(zhì)的區(qū)別，但現(xiàn)在我國(guó)大多數(shù)樣本庫建設(shè)還沒有發(fā)生質(zhì)的改變。
從國(guó)際范圍看，生物樣本庫的發(fā)展大致分為三個(gè)階段：首先是建立樣本庫，之后才可能是數(shù)據(jù)被共享，最后發(fā)展為樣本資源網(wǎng)絡(luò)。美國(guó)國(guó)家癌癥研究機(jī)構(gòu)研發(fā)的caTissue生物樣本資源庫管理軟件已經(jīng)成為全球最大的生物樣本資源交流平臺(tái)；法國(guó)也開發(fā)出生物樣本庫短信服務(wù)系統(tǒng)，通過手機(jī)短信建立起樣本貢獻(xiàn)者與樣本庫之間的聯(lián)系。
而據(jù)記者了解，我國(guó)生物樣本庫建設(shè)大多停留在第一階段，目前還缺乏全國(guó)性的生物樣本資源庫網(wǎng)絡(luò)，樣本信息無法與臨床等其他信息整合，使得樣本信息資源難以共享。
“目前階段最大挑戰(zhàn)就是生物樣本庫數(shù)據(jù)共享�！鄙虾Ｉ昕滇t(yī)院發(fā)展中心醫(yī)療事業(yè)部主任鄭培永就曾坦言，“中國(guó)的生物樣本庫數(shù)據(jù)共享就像戒煙一樣，說起來容易做起來難，都想用別人家的數(shù)據(jù)而自己不想提供，都顧慮自己的權(quán)益受到影響，怕自己的勞動(dòng)成果被別人竊取�！�
可以說，由于理念認(rèn)識(shí)上的問題，導(dǎo)致我國(guó)生物銀行信息化遇阻。一位英國(guó)學(xué)者的建議就較為中肯：“如果樣本庫建設(shè)繼續(xù)以樣本為軸心的策略發(fā)展，生物樣本庫將很難滿足日益受信息化影響的科研需要，甚至?xí)斐缮飿颖镜馁M(fèi)用性儲(chǔ)存的浪費(fèi)。因此生物樣本庫需要改變戰(zhàn)略重點(diǎn)，從生物樣本為主向以信息為中心的生物樣本信息庫轉(zhuǎn)變�！�
“銀行”亟待聯(lián)網(wǎng)升級(jí)
如何建立信息資源共享和整合系統(tǒng)，也就成為未來我國(guó)生物樣本庫建設(shè)的重點(diǎn)任務(wù)。
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院研究員劉雷在上述論壇上指出，在大數(shù)據(jù)時(shí)代，生命科學(xué)逐步向數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的科學(xué)發(fā)現(xiàn)模式發(fā)展，利用海量的生物數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)生命運(yùn)行的機(jī)制，其關(guān)鍵就是對(duì)生物大數(shù)據(jù)的解讀和利用。
“互聯(lián)網(wǎng)和大數(shù)據(jù)這兩個(gè)概念在現(xiàn)代生物樣本庫信息化建設(shè)和發(fā)展進(jìn)程中是必然存在的重要元素�！蓖鮽I(yè)同時(shí)指出，臨床信息、生物樣本和研究結(jié)果作為醫(yī)學(xué)研究的三大資源，皆為醫(yī)療大數(shù)據(jù)的來源，而數(shù)據(jù)和其產(chǎn)生的信息都需要通過互聯(lián)網(wǎng)交流發(fā)揮作用。
“通過生物技術(shù)可以挖掘生物樣本內(nèi)涵的生物活性，其產(chǎn)生的研究結(jié)果就是累積大量數(shù)據(jù)信息，隨之進(jìn)一步更加全面地反映生物樣本的生物特性�！蓖鮽I(yè)補(bǔ)充道。
為促進(jìn)生物樣本庫信息化建設(shè)，王偉業(yè)曾多次提出“平臺(tái)化醫(yī)學(xué)研究資源”的理念，主張樣本庫應(yīng)起多元素的樞紐作用，研究資源和應(yīng)用之間以平臺(tái)模式運(yùn)作與管理。
“這不是常說的某個(gè)平臺(tái)，而是要整個(gè)資源以平臺(tái)化結(jié)構(gòu)與模式，促進(jìn)資源與應(yīng)用或用戶之間的交流�！蓖鮽I(yè)介紹稱，平臺(tái)化首先要借助互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行信息交流，即提供資源與應(yīng)用結(jié)果反饋促進(jìn)資源滿足應(yīng)用/用戶更多需要。另外，平臺(tái)化包括的元素不應(yīng)該把生物樣本庫僅限于臨床疾病相關(guān)的信息資源，同時(shí)也應(yīng)該成為正常個(gè)人健康檔案資源。
來自浙江大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院的李昊?博士則提出共建“生物醫(yī)學(xué)研究協(xié)作網(wǎng)絡(luò)”的提議，該網(wǎng)絡(luò)的核心包括了快速匹配各研究者的需求，特別是對(duì)于各自生物樣本資源的共享和利用需求，也包括對(duì)多變的工作流程和科研規(guī)范的快速適應(yīng)的網(wǎng)絡(luò)工作平臺(tái)。
李昊?表示，上述平臺(tái)為不同地理位置、不同機(jī)構(gòu)、不同角色的用戶提供高效、安全和符合倫理的數(shù)據(jù)采集、分析和關(guān)聯(lián)服務(wù)，同時(shí)數(shù)據(jù)的共享也會(huì)更進(jìn)一步促進(jìn)相關(guān)的協(xié)作研究，更大規(guī)模的數(shù)據(jù)也可能帶來新的知識(shí)發(fā)現(xiàn)。
還有專家建議，生物樣本庫中使用的大部分資源也可以采用金融計(jì)算的方式。例如，精確的信息可以證實(shí)治療過程中不同因素的重要性和有效性，并以一種可以理解的形式展現(xiàn)出來，甚至可以預(yù)測(cè)治療的結(jié)果。
從專職到專業(yè)
“互聯(lián)網(wǎng)+”時(shí)代下，現(xiàn)代生物樣本庫更趨向于一個(gè)信息項(xiàng)目，如果沒有一個(gè)以數(shù)據(jù)為重心的策略，很難想象這家“銀行”還憑什么繼續(xù)支持現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究。
“國(guó)內(nèi)生物樣本庫仍不像是一個(gè)與研究非常緊密的機(jī)構(gòu)，為了讓自己表現(xiàn)得更專業(yè)，樣本庫通常雇幾個(gè)專職工作人員，但專職并不等同于專業(yè)�！蓖鮽I(yè)表示，由于樣本庫涉及的知識(shí)范圍很廣，如醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、分子生物學(xué)、冷凍保存技術(shù)、生物信息學(xué)和信息管理學(xué)等，從專職到專業(yè)是個(gè)復(fù)雜的學(xué)習(xí)過程。
王偉業(yè)表示，生物樣本庫的信息化管理是樣本資源所必需的，信息化和生物信息是兩個(gè)方向，而生物信息學(xué)需要這兩個(gè)領(lǐng)域的交叉人才�！叭藗�?nèi)菀装焉镄畔⒗斫鉃镮T，但是IT人員只能夠滿足要求的計(jì)算機(jī)功能，卻不知道生物領(lǐng)域的邏輯。因此需要生物學(xué)和IT人員緊密配合才能夠達(dá)到要求�！�
國(guó)內(nèi)對(duì)樣本庫信息化管理方面很容易把一些問題歸納為計(jì)算機(jī)的問題，其實(shí)有不少需求或者問題不一定是計(jì)算機(jī)方面的，比如樣本庫的信息如何標(biāo)識(shí)、怎么注解等相關(guān)問題，這不能只依賴IT工作，而是需要具有醫(yī)學(xué)生物專業(yè)知識(shí)的工作人員去做。
為此，王偉業(yè)建議，由于實(shí)驗(yàn)室的研究結(jié)果與樣本庫的專業(yè)程度緊密相關(guān)，所以，從業(yè)者如果一開始僅把建庫理解為做好儲(chǔ)存是沒有意義的，負(fù)責(zé)人應(yīng)該具有較高的專業(yè)化程度，承擔(dān)樣本庫工作的專職人員需要通過專業(yè)化的學(xué)習(xí)從專職成為專業(yè)人員，而不是把專職等同于專業(yè)。
本文來自：逍遙右腦記憶 http://portlandfoamroofing.com/chuzhong/393114.html
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